• facebook
  • linkedin
  • youtube

1. Lekola ho monya ha tharollo ea RNA

Absorbance ho 280, 320, 230, le 260 nm e emela litekanyetso tsa nucleic acid, background (solution turbidity), mahloriso a letsoai, le lintho tse phelang tse kang protheine, ka ho latellana.Ka kakaretso sheba feela OD260/OD280 (Karolelano, R).Ha 1.8 ~ 2.0, re nahana hore tšilafalo ea protheine kapa lintho tse ling tse phelang ho RNA li ka mamelloa, empa hoa lokela ho hlokomeloa hore ha Tris e sebelisoa e le buffer ho lemoha ho monya, boleng ba R bo ka ba bo boholo ho feta 2 (ka kakaretso e lokela ho ba <2.2).Ha R<1.8, tšilafalo ea protheine kapa lintho tse ling tse phelang ka tharollo e totobetse haholoanyane, 'me qetello ea RNA e ka khethoa ho ea ka litlhoko.Ha R> 2.2, ho bolela hore RNA e entsoe ka hydrolyzed hore e be nucleic acid e le 'ngoe.
 
2.Electrophoretic mohlala oa RNA
Ka kakaretso, gel ea denaturing e sebelisetsoa RNA electrophoresis, empa haeba e le feela bakeng sa ho lemoha boleng ba RNA, gel ea denaturing ha e hlokahale, 'me gel e tloaelehileng ea agarose e ka sebelisoa.Sepheo sa electrophoresis ke ho lemoha botšepehi ba lihlopha tsa 28S le 18S le karolelano ea tsona, kapa botšepehi ba mRNA smear.Ka kakaretso, haeba lihlopha tsa 28S le 18S li khanya, li hlakile, li bile li le bohale (ho bua ka mahlakoreng a lihlopha li hlakile), 'me khanya ea 28S e feta habeli ea sehlopha sa 18S, re nka hore boleng ba RNA bo botle.
Tse ka holimo ke mekhoa e 'meli eo re tloaetseng ho e sebelisa, empa ha ho le ea mong oa mekhoa ena e 'meli e ka re bolellang ka ho hlaka hore na ho na le RNase e setseng tharollong ea RNA.Haeba ho na le palo e nyenyane haholo ea RNase ka tharollo, ho thata ho rona ho e lemoha ka mokhoa o ka holimo, empa boholo ba liketso tse latelang tsa enzymatic li etsoa ka holimo ho likhato tse 37 le nako e telele.Ka tsela ena, haeba ho na le palo e nyenyane haholo ea RNase ka tharollo ea RNA, joale ho tla ba le tikoloho e loketseng haholo le nako ea ho bapala karolo ea bona litekong tse latelang, 'me ha e le hantle teko e tla bata ka nako ena.Ka tlase re kenyelletsa mokhoa o ka netefatsang hore na ho na le RNase e setseng ka tharollo ea RNA.
 
3. Teko ea ho boloka mocheso
Ho latela mohlala oa mahloriso, hula tse peli tsa 1000 ng RNA ho tsoa tharollong ea RNA 'me u e kenye ho 0.5 ml centrifuge tube,' me u e tlatse ka pH 7.0 Tris buffer ho kakaretso ea 10 ul, ebe u tiisa sekoahelo sa tube.Kenya e 'ngoe ea tsona sebakeng sa ho hlapa metsi ka mocheso o sa feleng ho 70 ° C 'me ue boloke e futhumetse bakeng sa 1 h.Karolo e 'ngoe e ne e bolokiloe ka sehatsetsing sa -20 ° C bakeng sa 1 h.Ha nako e felile, tlosa lisampole tse peli tsa electrophoresis.Ka mor'a hore electrophoresis e phethoe, bapisa lihlopha tsa electrophoretic tsa tse peli.Haeba lihlopha tsa tse peli li tsitsitse kapa li se na phapang e kholo (ho hlakile hore lihlopha tsa bona li boetse li finyella maemo a mokhoa oa 2), ho bolela hore ha ho na tšilafalo ea RNase e setseng ka tharollo ea RNA, 'me boleng ba RNA bo molemo haholo.Ho fapana le hoo, haeba sampole e kentsoeng ka 70 ° C e bontša ho senyeha ho totobetseng, ho bontša hore ho na le tšilafalo ea RNase ka tharollo ea RNA.
 
2 Mekhoa ea liteko le mekhoa ea ho ntša RNA
Mathata ao hangata re kopanang le ona ha re ntša RNA ke: (1) Kotulo ea RNA e tlaase;(2) RNA e na le tšilafalo e tebileng ea letsoai;(3) RNA e na le tšilafalo e tebileng ea metsoako ea lintho tsa tlhaho;(4) ho senyeha ha mohlala le mathata a mang
 
1. Ka tloaelo ho sebelisoa kakaretso ea RNA reagents
Mokhoa oa guanidine isothiocyanate le mokhoa oa Trizol ke mekhoa e sebelisoang ka ho fetisisa bakeng sa ho ntšoa ha RNA eohle ho tloha liseleng tsa liphoofolo le liseleng tsa liphoofolo.E loketse ka ho khetheha bakeng sa lisampole tse nyane le li-tissue tse thata haholo ho li ntša, joalo ka ho ntšoa ha RNA kaofela ho tsoa letlalong la mmutla le lisele tse hokahaneng tsa liphoofolo;Ho phaella moo, Trizol, e le mokhoa o akaretsang oa lysis reagent, e ka boela ea sebelisoa bakeng sa ho ntša lisele tsa semela, libaktheria, li-fungus le lisele tse ling.Bakeng sa lithane tsa semela tse nang le polysaccharides le polyphenols, joalo ka camellia oleifera, makhasi a tee, rapeseed, joalo-joalo, mokhoa oa CTAB le ona o ka sebelisoa ho ntša RNA kaofela.

E le mokhoa o tloaelehileng, mokhoa oa li-column tse peli o boetse o tumme haholo ka lebaka la ts'ebetso ea oona e tloaelehileng ea mocheso, ha ho hlokahale ho eketsa RNase, le polokeho-ha ho na chloroform, phenols le li-reagents tse ling tsa manyolo bakeng sa ho ntšoa.(lihlahisoa tse khothalletsoang )

1
2

2. Ho ntšoa ha RNA ka kakaretso ho tloha liseleng tsa liphoofolo
 
(1) Leka ho khetha lisele tse foreshe, haeba li se foreshe (haholo-holo nakong ea likhoeli tse tharo - 80 ℃ sehatsetsing kapa serame ka metsi a naetrojene.
(2) Sebelisa likere tse hloekileng le li-tweezers ho seha sekotoana se senyenyane sa linama, leka ho seha karolo e bohareng ea lesela ha u seha sampole, kapa pele u seha karolo e khōlō ea lesela ho tloha bohareng, ebe u khaola sampole sebakeng se secha sa ho seha.Lesela le tlositsoeng le lokela ho phunyeletsoa ka ho feletseng, le behe lesela le khabisitsoeng ka har'a tube ea EP ntle le RNase, le kenye lysate, lesela le khabisitsoeng le lokela ho pepeseha ka ho feletseng ho lysate, 'me le itokisetse homogenization.

(3) Bakeng sa li-tissue tse tloaelehileng, khetha lithane tse boholo ba linaoa tsa mung (30-60 mg) bakeng sa homogenization.Haeba lisele li na le liprotheine tse ngata, mafura, kapa li-tissue tse teteaneng tse kang sebete, ka ho loketseng eketsa kapa fokotsa palo ea lisele tse sehiloeng (ho ikhethela) Khetha 10 ~ 20 mg).
(4) Haeba mesifa ea tlhapi, nama ea shrimp, jellyfish le li-tissue tse ling tse nang le metsi a mangata li ntšoa, molumo oa sampole o lokela ho eketsoa ka nepo (ho khothaletsoa 100-200 mg).
45
(6) RNA e fumanoang ka mor'a ho tlosoa ha ho qetela e tlameha ho behoa ka lebokoseng la leqhoa hang-hang ho fokotsa ho senyeha ha RNA.

3. Ho ntšoa ha RNA ea sele ea liphoofolo

(1) Lisele tse emisitsoeng: centrifuge ka ho toba 'me u lahle sehare, hlatsoa ka PBS e sa hloekang bakeng sa linako tse 1-2, ebe u emisa ka tekanyo e nepahetseng ea PBS, ebe u eketsa lysate bakeng sa lysis.U se ke ua eketsa lysate ka ho toba liseleng tse omeletseng ka mor'a ho lahla metsi ka ho feletseng.Sena se tla etsa hore sephutheloana sa histone se lokolloe ka mor'a hore lisele tsa lysed tse karolong e ka ntle li khomarele ka ntle ho lisele tse fokolang, kahoo li fokotsa ho kopana ha lisele tse ka hare ho pellet le lysate., e hlahisang lisele tse sa fellang lysis le ho fokotsa lihlahisoa tsa RNA.

(2) Lisele tse nang le li-semi-adherent kapa tse sa khomareleng ka thata: Ka mor'a ho lahla sehare, hlatsoa ka PBS ka makhetlo a 1-2, ebe u monya ka ho toba palo e loketseng ea PBS 'me u phunye sejana sa setso ka pipette kapa sethunya ho phunya lisele, ebe u li fetisetsa liseleng tse se nang RNA.Kenya lysate ho EP tube ea enzyme bakeng sa ho ntšoa.

(3) Lisele tse khomarelang: li hloka ho cheka ka trypsin pele, ebe li bokelloa ka har'a li-tubes tsa EP tse se nang RNase, tse centrifuged ho tlosa supernatant, li hlatsuoa ka makhetlo a 1-2 ka PBS ho tlosa trypsin e feteletseng, le ho tsosolosoa ka tekanyo e loketseng ea PBS Ebe u tsoela pele mohato oa ho ntša.

4. Ho ntšoa ha RNA ea limela

Li-tissue tsa semela li na le metsoako e mengata ea phenolic, kapa li na le li-polysaccharides tse ngata, kapa li na le metabolite ea bobeli e sa tsejoeng, kapa li na le ts'ebetso e phahameng ea RNase.Lintho tsena li kopantsoe ka thata le RNA ka mor'a sele lysis ho etsa li-insoluble complexes kapa li-colloidal precipitates, tseo ho leng thata ho li tlosa.Ka hona, ha re ntša lisele tsa semela, re lokela ho khetha lisebelisoa bakeng sa limela.Li-lysate tse ka har'a kit li ka rarolla mathata a bonolo a oxidation ea polyphenols le ho arohana ha metsoako ea polysaccharide le nucleic acid.

(Bakeng sa tlhahiso ea RNA ea polysaccharide polyphenol, lihlahisoa tse khothalelitsoeng:

(1) Lekhapetla, lekhapetla, peo, makhasi, joalo-joalo tsa semela li lokela ho siloa ka botlalo ka seretse.Nakong ea ts'ebetso ea ho sila, naetrojene e metsi e lokela ho tlatsetsoa ka nako ho qoba ho qhibiliha sampole.Mohlala oa fatše o lokela ho kenngoa ka potlako ho lysate le ho sisinyeha ho qoba ho senyeha ha RNA.

(2) Bakeng sa lisampole tse nang le fiber tse ngata tse kang raese le makhasi a koro, palo ea ho ntšoa e lokela ho fokotsoa ka mokhoa o nepahetseng, ho seng joalo ho sila ha lisele le lysis ho ke ke ha fella, ho fella ka chai e tlaase ea RNA e nkiloeng.

(3) Bakeng sa lisele tsa semela tse nang le metsi a mangata, joalo ka tholoana ea kharenate, litholoana tsa mahapu, litholoana tsa perekisi, joalo-joalo, boholo ba sampole bo lokela ho eketsoa ka nepo (100-200 mg ke boikhethelo).

(4) Li-tissue tsa semela, joalo ka makhasi a semela, li-rhizomes, litholoana tse thata le lisebelisoa tse ling hangata li khothaletsoa ho sebelisa naetrojene e metsi ho kopanya metsoako ka seretse ka botlalo, ebe o fetela mohatong oa ho hula.Li-tissue homogenizers tse tloaelehileng li kanna tsa se sebetse hantle ho homogenizing lithane tsa semela, 'me ka kakaretso ha lia khothaletsoa.

5. Litlhokomelo bakeng sa ho ntšoa ha RNA

(1) Lisampole tsa maqeba li lokela ho ba tse ncha ka hohle kamoo ho ka khonehang ho qoba ho qhoqhoa khafetsa le ho qhibiliha.

(2) Lesela le lokela ho siloa ka ho feletseng nakong ea ho ntšoa, ’me palo ea linama ha ea lokela ho ba nyenyane haholo, re se re sa re letho ka e ngata haholo.

(3) Nako e lekaneng ea ho qhoqhoa e lokela ho fanoa ka mor'a ho eketsa lysate ho hlahisa sampuli ka botlalo.

(4) Ha u sebelisa mokhoa oa Trizol bakeng sa ho ntšoa, molao-motheo oa ho monya matla a phahametseng tlhaho ka mor'a stratification "ho khetha ho hema ka tlaase ho ho feta ho feta", 'me ha oa lokela ho ntša lera le bohareng, ho seng joalo e tla baka tšilafalo e tebileng ea genomic DNA.

(5) Ha o hlatsoa, ​​​​mokelikeli oa ho hlatsoa o lokela ho kenella ka ho feletseng ho pota lerako la tube ho etsa bonnete ba ho hlatsoa ka ho feletseng.

(6) Bakeng sa mokhoa oa ho ntša litšiea, ntle le ho tlosa tšiea ka mor'a ho hlatsoa, ​​​​kholomo ea adsorption e boetse e lokela ho behoa bencheng e hloekileng haholo 'me e butsoe ka metsotso e 5-10 ho etsa mouoane ka ho feletseng mokelikeli oa tlhaho ho omella.

(7) Qetellong ea mokhoa oa ho qetela oa mokhoa, ka mor'a ho eketsa metsi a DEPC, e lokela ho kenngoa ka metsotso ea 3-5, kapa metsi a DEPC a lokela ho futhumala ho 60 ° C esale pele ho eketsa lihlahisoa tsa elution.Ka mokhoa o tloaelehileng oa Trizol cleavage le isopropanol precipitation, RNA ea ho qetela e qhibiliha ka metsing a DEPC, kahoo nako e loketseng e lokela ho fanoa bakeng sa ho qhibiliha, 'me karolo e ka tlaase ea tube ea centrifuge e lokela ho tsoela pele ho butsoe ka pipette.

3 Three Lisosa le tharollo bakeng sa mahloriso a tlase a RNA / boleng bo bobe
 
1. Kotulo e tlase haholo
Mohlala o ntšitsoeng o tlase haholo, chelete eohle ha e lekane, kapa sampuli e nkiloeng e ngata haholo 'me lysis ha ea phethoa;lisele kapa lisele tsa boleng bo nepahetseng li lokela ho sebelisoa bakeng sa ho ntšoa, phekolo ea pele ea sampuli e lokela ho etsoa hantle, 'me lysis e lokela ho lekana.
 
2. Masalla a Genome
Ha ho ntšoa ka mokhoa oa Trizol, ha supernatant e kenngoa ka har'a lera le bohareng ka mor'a ho beha, ho tla ba le tšilafalo e tebileng ea genome;tlhokomelo e eketsehileng e lokela ho nkoa ha ho behoa ho qoba ho monya lera le bohareng.Haeba mokhoa oa kholomo o sebelisoa bakeng sa ho ntšoa, ho ka khethoa khiti e nang le DNase I bakeng sa ho ntšoa.Nucleic acid e adsorbed ka lera e chekoa ka kotloloho ka DNase I, e ka fokotsang masala a DNA haholo.
 
3. Ho senyeha ha RNA
E ka 'na ea e-ba ho senyeha ha sampuli e nkiloeng ka boeona, kapa ho senyeha ho bakoang nakong ea ts'ebetso ea ho ntša;ka moo ho kgonehang ka teng, disampole tse foreshe di lokela ho sebediswa bakeng sa ho ntshiwa ha RNA, mme disampole tse bokeletsweng di lokela ho bolokwa mokelikeli wa nitrogen kapa -80°C sehatsetsing ka nako, mme ho qojwa ka serame le ho qhibidiha hangata.Litlhahiso tsa mahala tsa RNase / DNase, li-tubes tsa centrifuge le lisebelisoa tse ling li lokela ho sebelisoa ts'ebetsong ea ho ntša RNA.Ts'ebetso ea ho ntša e lokela ho ba kapele kamoo ho ka khonehang.RNA e nkiloeng e lokela ho behoa ka lebokoseng la leqhoa ebe e bolokoa ho -80 ka nako.Haeba RNA e ntšitsoeng e hloka ho fumanoa ka gel electrophoresis, electrophoresis e lokela ho etsoa hang ka mor'a ho ntšoa, 'me buffer ea electrophoresis e lokela ho nkeloa sebaka ke e sa tsoa lokisoa.
 
4. Masala a letsoai le a organic solvent
Li-reagents tsa ho ntša li na le letsoai la phenol le guanidine, 'me tharollo ea ho hlatsoa e na le ethanol.Nakong ea ts'ebetso ea ho ntša, lysate ha ea ka ea kenngoa ka ho feletseng le ho lahloa, 'me tharollo ea ho hlatsoa e ne e sa omisoa ka ho feletseng.Matsoai a setseng le metsoako ea lintho tse hlapollang e kotsi ho phetisetso ea morao-rao le PCR.Likhato tse fapaneng tsa ho thibela, kahoo lysate ea lisele e lokela ho tlosoa ka ho feletseng nakong ea ts'ebetso ea ho ntša, 'me ho hlatsoa ho lokela ho lekana e le hore marako a potolohileng tube a ka hlatsuoa.Ho phaella moo, tube e tšolotsoe 'me e butsoe ke mohato o hlokahalang, o tla fokotsa ho feta masala a lintho tse phelang.
 
Bakeng sa tlhaiso-leseling e batsi mabapi le ho ntšoa ha RNA, ka kopo latela sebaka sa rona sa marang-rang:
www.foreivd.com bakeng sa tlhaiso-leseling e batsi.

7

Nako ea poso: Dec-01-2022